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《安徽师范大学学报（自然科学版）》（双月刊）创办于1957年。1973年复刊以来，发表自然科学领域基础研究与应用研究方面的学术论文2千余篇，大多数被相关专业文摘收录。1995、1998、2001、2005年连续四次被安徽省科技厅评为“安徽省优秀科技期刊”。2005年10月荣获“第五届安徽省优秀科技期刊二等奖”。1995、1999年被安徽省教育厅评为“安徽省高等院校优秀学报”；2004年被安徽省新闻出版局、安徽省教育厅评为“安徽省高等学校优秀学报”。 《安徽师范大学学报（自然科学版）》近年来，本刊发表的有关“扬子鳄”、“稀土有机”、“凝聚态与晶体材料”、“奇异摄动”、“泛函”等研究成果，在国内外学术界产生较大反响，德国《数学文摘》、《美国数学评论》多次对本刊发表的数学论文给予介绍并作出较高评价。获奖情况：安徽省高等院校优秀学报；安徽省优秀高校学报；安徽省科技期刊二等奖。
《安徽师范大学学报》（人文社会科学版）（双月刊）创办于1957年5月，历经《安徽师范学院学报》《合肥师范学院学报》等几次更名，文革期间曾一度停刊，1973年复刊，迄今出版37卷161期。 《安徽师范大学学报》（人文社会科学版）坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻科学发展观，以繁荣人文社会科学，推动物质文明、政治文明和精神文明建设为宗旨，文史见长，严谨求实，体现师范特色、地方特色和时代特色。获奖情况：中文核心期刊(2011)、中文核心期刊(2008)、安徽省优秀社科期刊、安徽省高校优秀学报一等奖、北大2008版核心期刊。